يُنتج الليسيثين الشفاف عن طريق تكرير وتبييض الليسيثين القياسي لإزالة الشوائب الملوّنة والأصباغ.
ينتج عن ذلك ليسيثين سائل شفاف أصفر فاتح بلون وشفافية محسّنين بشكل ملحوظ. يُستخدم في التطبيقات التي يكون فيها الوضوح البصري واللون الفاتح أمراً بالغ الأهمية — المشروبات المستحلبة الشفافة والحلويات الفاخرة ومستحضرات التجميل وتركيبات الأغذية الراقية.