Les fructooligosaccharides sont produits soit par transfructosylation enzymatique du saccharose à l'aide de β-fructosidase fongique, soit par hydrolyse partielle de l'inuline de racine de chicorée.
Le produit obtenu contient du kestose (GF2), du nystose (GF3) et du fructofuranosyl-nystose (GF4) à une pureté ≥ 95%. Les FOS offrent 30–60% du pouvoir sucrant du saccharose avec seulement 2 kcal/g, zéro réponse glycémique et un effet prébiotique cliniquement prouvé.