クロトンアルデヒドはアセトアルデヒドのアルドール縮合に続く脱水によって工業的に製造されます。主な商業用途はソルビン酸およびソルビン酸カリウム(E200、E202)—主要な食品保存料—の合成における前駆体、およびブチルアルデヒド、1-ブタノール、各種フレーバー・フレグランス化合物の製造です。
クロトンアルデヒド自体は厳密に中間体であり、最終食品製品には含まれないため、食品グレード材料の適用はありません。工業グレードは通常蒸留により純度≥ 99%です。高い反応性と催涙性を持ち、保管中の重合防止のため専門的な取り扱い、冷蔵、抑制剤(ハイドロキノン)の添加が必要です。